Consta de 26 episodios y 2 especiales "Summary" y "Gakuen Senki Muryou Report: Muryou Fanclub".
En el año 2070, un objeto gigante aparece misteriosamente en Tokyo. De este incidente, el gobierno reconoce la presencia de formas de vida alienígenas. Durante este tiempo, Muryo Subaru ha sido trasladado a una nueva escuela. El vicepresidente del consejo escolar, Kyoichi, tiene una pelea con el nuevo chico, Muryo, algo muy típico cuando alguien nuevo entra. Pero Kyoichi y Muryo muestran técnicas especiales de lucha en su combate. ¿Por qué tienen estos chicos esos poderes especiales? ¿Tendrá algo que ver con el misterioso objeto aparecido en Tokyo?