Guilty Crown: Lost Christmas nos sitúa en diciembre del año 2029, 10 años antes de la historia de la serie, y nos narra los hechos de cuando ocurrió la llamada Navidad Perdida, un terrible virus que infectó a una enorme parte de la población japonesa e hizo caer al país, que fue reflotado gracias a las Naciones Unidas, que estableció un nuevo gobierno llamado GHQ.
24 de diciembre de 2029. Roppongi, Tokio. ¿Qué ocurrió en realidad aquella noche en la que la nieve no paraba de caer?