Zeiram, la más peligrosa forma de vida de la galaxia es virtualmente imparable, puede incluso que invulnerable. La Tedan Tippedai Corporation ha intentado secretamente hacerse con Zeiram para usarlo como base de una nueva y poderosa bio-arma, y ahora está suelto por ahí. Iria, una joven caza-recompensas cuyo hermano fue masacrado por Zeiram, descubre esta información mientras lucha con un monstruo (las pruebas de estos encuentros han sido ocultadas). Ahora Iria deberá descubrir la silenciosa conspiración antes de que muera más gente inocente a manos de Zeiram. Con la ayuda de su joven aprendiz, Kei, y un misterioso benefactor, Iria vengará la muerte de su hermano... pero ¿quién está dando caza a quién?