La historia de Kanokon gira entorno de Kouta Oyamada, un estudiante de primer año de instituto que se traslada al Instituto Kunpo. Durante su primer día en su nueva escuela, una hermosa estudiante de segundo año llamada Chizuru Minamoto le pide juntarse con ella en el salón de música. Cuando él llega, ella la revela que es una deidad de zorro y desde ese día los dos andan juntos. Nozomu es una estudiante de primer año en la el instituto Kunpo , ella es de hecho una deidad de lobo la cual está enamorada de Kouta. Como rival de Chizuru luchará por el amor de Kouta.