Cuenta la leyenda que hace mucho, muchos años atrás unos seres llamados angeles cazan a los humanos para quitar su energia (Prana). Por supuesto la humanidad se revela ante ellos y comienza una batalla épica. Pero en una de las luchas, el angel Apollonius se enamora a primera vista con una guerrera humana llamada Celiane; Desde ese momento decide unirse a los humanos y luchar contra su raza. Gracias a la sabiduria de Apollonius logran construir un mecha con la que podría luchar a la par de sus enemigos, llamada Aquarion. Ahi conoce a un noble guerrera, Scorpius, con quien junto con Celiane manejan el Aquarion. Pero Scorpius comienza a admirar el poder de los angeles y traiciona a los suyos matando a Apollonius...