Totoro es un espíritu del bosque a quien encuentran la pequeña Mei y su hemana mayor Satuski en un árbol gigante cerca de su casa en el campo.
Su padre es profesor de universidad y su madre se encuentra enferma en el hospital en la cidudad. Cuando Mei se entera de que su madre puede estar empeorando, decide ir ella sola a visitarla. Cuando todo el mundo se da cuenta de que ha desaparecido sólo Totoro sabe dónde encontrarla.